富禾生醫設有良好的組織結構，其架構包含董事會、董事長、總經理、稽核室、科學諮詢委員會、總經理室、研製處及品保室等經營管理層，並設有八個部門，分別為財會部、行政部、業務行銷部、總務部、臨床部、測試實驗室、製程部及研發部，透過各部門專精技能資源及分工合作，來維持公司整體運作（如下圖）。